QM/MM и что-то полезное

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Marxist

QM/MM и что-то полезное

Сообщение Marxist » Пн апр 09, 2007 9:42 pm

Идея такая. Есть белок и есть лиганд этого белка -- полусэндвичевый комплекс рутения (II). Есть рентген белка, есть рентген родственного белка с этим комплексом в качестве лиганда, есть рентген лиганда. Соответственно вопрос: что полезного можно сделать исходя из этого с применением метода QM/MM и вообще стоит ли затевать историю; кроме того, хочется знать, насколько хорошо существующие квантовые методы применимы для комплексов рутения (скорость-качество).
Если кто-то желает сделать эту работу -- welcome.

Аватара пользователя
pH<7
Сообщения: 4236
Зарегистрирован: Ср апр 21, 2004 6:48 pm
Контактная информация:

Сообщение pH<7 » Пн апр 09, 2007 9:44 pm

Уж не карборановый ли комплекс?
Carpe diem

Marxist

Сообщение Marxist » Пн апр 09, 2007 9:47 pm

Нет-нет, отнюдь. Вокруг рутения --- ароматика и СО.

Аватара пользователя
pH<7
Сообщения: 4236
Зарегистрирован: Ср апр 21, 2004 6:48 pm
Контактная информация:

Сообщение pH<7 » Пн апр 09, 2007 9:51 pm

Carpe diem

Marxist

Сообщение Marxist » Пн апр 09, 2007 9:54 pm

Именно про эти лиганды речь и идёт; так что не офф

Аватара пользователя
pH<7
Сообщения: 4236
Зарегистрирован: Ср апр 21, 2004 6:48 pm
Контактная информация:

Сообщение pH<7 » Пн апр 09, 2007 10:00 pm

Над страуспорином очень много работали, я думаю, что что-то подобное сделано и нужно копать тщательнее.
Carpe diem

Marxist

Сообщение Marxist » Пн апр 09, 2007 10:05 pm

Комплексам всего-то два года. Мне интересно именно с точки зрения QМ/MM.

Nord
Сообщения: 2227
Зарегистрирован: Сб фев 14, 2004 5:36 pm

Сообщение Nord » Чт апр 12, 2007 1:50 pm

Я сейчас работаю с полуценами переходных металлов (3d). Там крайне тяжелая квантовая химия. QM/MM сахару не прибавляет, хотя, наверное, особо и не усложняет в сравнении с "голым" ценом.
Не важно, что о вас говорят современники, важно что о вас скажут потомки

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 0 гостей