Какую квантовую программу покупать?
-
- Сообщения: 9505
- Зарегистрирован: Вт дек 21, 2004 11:42 am
Какую квантовую программу покупать?
Есть желание и возможность купить чего-то для квантов. Посоветуйте, плиззз, что оптимальнее.
Задачи: довольно большие системы, пептиды аминокислот на 5-10-20, куски синтетических полимеров, атомы: С. Н, N, S, Si, Zn, Cu и что еще в голову начальству взбредет...
Сейчас для своего удовольствия гоняем HyperChem (полуэмпирику), в принципе удовлетворяет, но цена... Также желательно, чтобы был вариант под UNIX (есть многопроцессорный монстрик).
Задачи: довольно большие системы, пептиды аминокислот на 5-10-20, куски синтетических полимеров, атомы: С. Н, N, S, Si, Zn, Cu и что еще в голову начальству взбредет...
Сейчас для своего удовольствия гоняем HyperChem (полуэмпирику), в принципе удовлетворяет, но цена... Также желательно, чтобы был вариант под UNIX (есть многопроцессорный монстрик).
Платные варианты:
1.Gaussian 03 под Linux
2.MolPro
Но сейчас есть много вариантов бесплатных программ, мало уступающих коммерческим:
1. GAMESS
2. Priroda
По скорости расчёта все хвалят MolPro. Gaussian хорош тем, что позволяет автоматизировать множество "ручных" задач.
PS: Какой-нибудь GAMESS вышу полуэмпирику в 100 раз быстрее посчитает, чем HyperChem. Уж лучше тогда визуализатор ChemCraft (www.chemcraftprog.com) купить.
1.Gaussian 03 под Linux
2.MolPro
Но сейчас есть много вариантов бесплатных программ, мало уступающих коммерческим:
1. GAMESS
2. Priroda
По скорости расчёта все хвалят MolPro. Gaussian хорош тем, что позволяет автоматизировать множество "ручных" задач.
PS: Какой-нибудь GAMESS вышу полуэмпирику в 100 раз быстрее посчитает, чем HyperChem. Уж лучше тогда визуализатор ChemCraft (www.chemcraftprog.com) купить.
-
- Сообщения: 9505
- Зарегистрирован: Вт дек 21, 2004 11:42 am
Найдите какую-нибудь последнюю статью автора программы - Лайкова Д.Н (Laikov D.N.), там есть его e-mail. Раздачей программ занимается он лично, пока программа в стадии тестирования и открытый доступ к ней не разрешается.Polychemist писал(а):Спасибо! А вот насчет Prirod-ы - а где взять? Есть ли официальный сайт? Гугль как-то не шибко помог...
-
- Сообщения: 426
- Зарегистрирован: Чт май 24, 2007 1:54 pm
Наверное, Гауссиан и МолПро плохо подойдут для таких дел. Мне кажется, стоит обратить внимание на:
NWChem - мощная программа, разработанная специально для больших параллельных кластеров, умеет делать QM/MM
CPMD или CP2k - "стандарты" для ab initio молекулярной динамики, тоже поддерживают QM/MM
SIESTA или OpenMX или Conquest (выходит в сентябре) - программы, специально разработанные для расчётов _больших_ систем (тысячи атомов); последние две скорее для материаловедения и нанотехнологий, но биологические задачи тоже решают. Разработчики SIESTA обещают в будущем и QM/MM, но пока - нет.
Все программы бесплатные, но впечатления от тех, что пробовал, в миллионы раз лучше, чем от Гауссиана.
МолПро хорошо тем, что умеет делать локальное MP2, но оно Вам надо?
Вообще, лучше всего посмотреть по публикациям, кто чем пользуется.
NWChem - мощная программа, разработанная специально для больших параллельных кластеров, умеет делать QM/MM
CPMD или CP2k - "стандарты" для ab initio молекулярной динамики, тоже поддерживают QM/MM
SIESTA или OpenMX или Conquest (выходит в сентябре) - программы, специально разработанные для расчётов _больших_ систем (тысячи атомов); последние две скорее для материаловедения и нанотехнологий, но биологические задачи тоже решают. Разработчики SIESTA обещают в будущем и QM/MM, но пока - нет.
Все программы бесплатные, но впечатления от тех, что пробовал, в миллионы раз лучше, чем от Гауссиана.
МолПро хорошо тем, что умеет делать локальное MP2, но оно Вам надо?
Вообще, лучше всего посмотреть по публикациям, кто чем пользуется.
-
- Сообщения: 426
- Зарегистрирован: Чт май 24, 2007 1:54 pm
-
- Сообщения: 426
- Зарегистрирован: Чт май 24, 2007 1:54 pm
Да, а эта тема посвящена выбору программ, "Природа" здесь упоминалась, и для удачного выбора неплохо было бы знать, что она сейчас умеет.Cherep писал(а):По "природе" было несколько отдельных тем
В отдельных темах я ответа на этот вопрос не увидел - плохо смотрел?
Ну и напишем сразу, где что взять:
CP2k, OpenMX, Conquest - скачать с оф.сайтов
CPMD - оставить заявку на оф.сайте
NWChem и SIESTA - отправить заявку по почте
Priroda - отправить e-mail автору
Gaussian и MolPro - купить на оф.сайтах
-
- Сообщения: 426
- Зарегистрирован: Чт май 24, 2007 1:54 pm
Priroda 6Darth Vasya писал(а):Имхо, как раз получится не каша, а информативное сравнение. Удобнее, чем по теме на программу. Имхо.
task=%s job type, values are:
energy
gradient
hessian
optimize - geometry optimization - see $optimize
irc - intrinsic reaction coordinate - see $optimize
scan - relaxed potential energy surface scan
- see $optimize
nmr - NMR shielding tensors (DFT only)
dipole - numeric evaluation of dipole polarizabilities
and their first derivatives w.r.t. nuclear coordinates
...
theory=%s theoretical method:
dft - GGA DFT using density fitting
ridft - hybrid DFT with exact exchange using
resolution-of-identity integral approximiation
tddft - GGA time-dependent DFT
rimp2 - second-order M\oller-Plesset perturbation theory
using the RI approximation
ccsd - CCSD
ccsd4t - CCSD(T)
Re: Какую квантовую программу покупать?
Turbomole (RI-метод) или ,как уже посоветовали, MOLPRO (Local-метод). Если QМ/ММ, то GUK (GAMESS-UK), MOLCAS.Polychemist писал(а):Есть желание и возможность купить чего-то для квантов. Посоветуйте, плиззз, что оптимальнее.
Задачи: довольно большие системы, пептиды аминокислот на 5-10-20, куски синтетических полимеров, атомы: С. Н, N, S, Si, Zn, Cu и что еще в голову начальству взбредет...
.
Best regards,
Vic.
ну для кучи можно предложить ADF (www.scm.com)
умеет очень хорошо делать DFT по-амстердамски (Amsterdam Density Func.)
релятивистские и нерелятивистские расчеты, переходные металлы - все это ей по зубам уже давно
проблема только в цене - дороговато получается
умеет очень хорошо делать DFT по-амстердамски (Amsterdam Density Func.)
релятивистские и нерелятивистские расчеты, переходные металлы - все это ей по зубам уже давно
проблема только в цене - дороговато получается
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 3 гостя