Сравнение скоростей gaussian'а на машинах с IA32 и EM64T

Yurii · Сообщение **Yurii** » Ср сен 05, 2007 10:05 am

Скорость грамотно оттранслированного Gaussian'а g03 на Core 2 Duo E6700 под EM64T в 6 раз превышает скорость его распространяемой версии под Windows на P4 3.6 GHz под IA32. Почему такая большая разница? Одной многоядерностью и большей скоростью процессора этого не объяснить. У меня одно предположение: они транслировали его без оптимизции кода. В exchange выложены расчеты димера C120 (B3LYP/6-31g и rhf/6-311g*) на Core 2 Duo. Конфигурацию железа см.: http://www.thesa-store.com/products/

Rt19 · Сообщение **Rt19** » Пн сен 10, 2007 12:27 am

О какой ревизии под Win платформу идет речь?

Yurii · Сообщение **Yurii** » Пн сен 10, 2007 8:22 am

Rt19 писал(а):О какой ревизии под Win платформу идет речь?

С02

Nord · Сообщение **Nord** » Пн сен 10, 2007 9:54 am

Юрий, когда вы говорите о сборках, следует указывать не только архитектуру процессоров, но и компилятор (название и версию), использованные ключи оптимизации и использованные библиотеки. Только обладая этой информацией (это самый минимум) можно пытаться сравнивать производительность.

Yurii · Сообщение **Yurii** » Пн сен 10, 2007 11:07 am

Nord писал(а):Юрий, когда вы говорите о сборках, следует указывать не только архитектуру процессоров, но и компилятор (название и версию), использованные ключи оптимизации и использованные библиотеки. Только обладая этой информацией (это самый минимум) можно пытаться сравнивать производительность.

Для Win нет исходного кода, и gaussian не пишет, что, как и почему (правда, один умелец переделал линуксовый код под Win).

Nord · Сообщение **Nord** » Пн сен 10, 2007 11:09 am

Yurii писал(а):
Nord писал(а):Юрий, когда вы говорите о сборках, следует указывать не только архитектуру процессоров, но и компилятор (название и версию), использованные ключи оптимизации и использованные библиотеки. Только обладая этой информацией (это самый минимум) можно пытаться сравнивать производительность.
Для Win нет исходного кода, и gaussian не пишет, что, как и почему (правда, один умелец переделал линуксовый код под Win).

По крайней мере, для меня это не проблема - я сижу под Linux. И процессор у меня тоже C2D, только пропроще - E4300 (1.8 ГГц).

Yurii · Сообщение **Yurii** » Пн сен 10, 2007 12:29 pm

Nord писал(а):
Yurii писал(а):
Nord писал(а):Юрий, когда вы говорите о сборках, следует указывать не только архитектуру процессоров, но и компилятор (название и версию), использованные ключи оптимизации и использованные библиотеки. Только обладая этой информацией (это самый минимум) можно пытаться сравнивать производительность.
Для Win нет исходного кода, и gaussian не пишет, что, как и почему (правда, один умелец переделал линуксовый код под Win).
По крайней мере, для меня это не проблема - я сижу под Linux. И процессор у меня тоже C2D, только пропроще - E4300 (1.8 ГГц).

Отвечаю на содержательную часть ответа. Раз у Вас C2D, то и поставьте C120, а то Yu/2 занимается чистой спекуляцией (на коей его местичковый рейтинг стремительно вырос) на различии в железе. У меня еще будет ему ответ по этому поводу. Пока я вижу, что для него 6-311G* для pc gamess и gaussian - одно и тоже.

Nord · Сообщение **Nord** » Пн сен 10, 2007 12:34 pm

Yurii писал(а):Отвечаю на содержательную часть ответа. Раз у Вас C2D, то и поставьте C120, а то Yu/2 занимается чистой спекуляцией (на коей его местичковый рейтинг стремительно вырос) на различии в железе. У меня еще будет ему ответ по этому поводу. Пока я вижу, что для него 6-311G* для pc gamess и gaussian - одно и тоже.

Я поставил и давно уже результаты получил, о чём Вам сообщил. Но Вы не изволили мне поверить.
Мой gamess считает медленнее, причём существенно, но не на порядки, причём на обычно десктопной машинке с 1Gb оперативной памяти. Но сборка у меня под IA32, gcc/gfortran (а не icc/ifort) и без оптимизованных blas/lapack от Интела.

Darth Vasya · Сообщение **Darth Vasya** » Пн сен 10, 2007 7:04 pm

Nord писал(а):и без оптимизованных blas/lapack от Интела.

Вам поможет ACML от AMD, а также GotoBLAS

Darth Vasya · Сообщение **Darth Vasya** » Пн сен 10, 2007 7:09 pm

П.С.: Правда, Юрий Вас всё равно побьёт своей секретной диагонализацией

Yurii · Сообщение **Yurii** » Пн сен 10, 2007 7:21 pm

Darth Vasya писал(а):П.С.: Правда, Юрий Вас всё равно побьёт своей секретной диагонализацией

Для неэмпирики моя диагонализация-это чушь собачья.

Nord · Сообщение **Nord** » Пн сен 10, 2007 7:26 pm

Darth Vasya писал(а):
Nord писал(а):и без оптимизованных blas/lapack от Интела.
Вам поможет ACML от AMD, а также GotoBLAS

Честно - лень

Когда-то мне нравилось собирать с предельной оптимизацией. А сейчас хочется побыстрее заняться своим делом. Да и тестировать - утомительное занятие.

Darth Vasya · Сообщение **Darth Vasya** » Пн сен 10, 2007 10:32 pm

ACML и компилировать не надо: http://developer.amd.com/acml.jsp - выбираете свою битность и вперёд! Для IA32 Вам, наверное, лучше всего подойдёт вот это: http://developer.amd.com/devDownloadPro ... &section=5. Да и оттестирована она вдоль и поперёк. Сам её использую на Интеловских машинах. Сравнивал на EM64T с MKL 10 - разница совсем небольшая.

Yurii · Сообщение **Yurii** » Вт сен 11, 2007 1:01 pm

Nord писал(а):
Yurii писал(а):Отвечаю на содержательную часть ответа. Раз у Вас C2D, то и поставьте C120, а то Yu/2 занимается чистой спекуляцией (на коей его местичковый рейтинг стремительно вырос) на различии в железе. У меня еще будет ему ответ по этому поводу. Пока я вижу, что для него 6-311G* для pc gamess и gaussian - одно и тоже.
Я поставил и давно уже результаты получил, о чём Вам сообщил. Но Вы не изволили мне поверить.
Мой gamess считает медленнее, причём существенно, но не на порядки, причём на обычно десктопной машинке с 1Gb оперативной памяти. Но сборка у меня под IA32, gcc/gfortran (а не icc/ifort) и без оптимизованных blas/lapack от Интела.

Дело не в вере, а в том, что Вы отказались показать свой расчет, чтобы пользователь gamess осознал роль внешних носителей на десктопе(сборка и оптимизированные библиотеки здесь отходят на 2 план). А то, что Вы отважились на такой расчет - честь Вам и хвала. У меня терпенья не хватило даже на pc gamess.

Nord · Сообщение **Nord** » Вт сен 11, 2007 1:33 pm

Yurii писал(а):Дело не в вере, а в том, что Вы отказались показать свой расчет, чтобы пользователь gamess осознал роль внешних носителей на десктопе(сборка и оптимизированные библиотеки здесь отходят на 2 план)

Я сразу считал в direct варианте, потому что у меня действительно медленный диск 5-летней давности. И как раз здесь всё упиралось в процессор и оптимизацию.
Да, я ещё считал не pc-gamess'ом, а оригинальным gamess-us

Yurii · Сообщение **Yurii** » Вт сен 11, 2007 6:10 pm

Nord писал(а):
Yurii писал(а):Дело не в вере, а в том, что Вы отказались показать свой расчет, чтобы пользователь gamess осознал роль внешних носителей на десктопе(сборка и оптимизированные библиотеки здесь отходят на 2 план)
Я сразу считал в direct варианте, потому что у меня действительно медленный диск 5-летней давности. И как раз здесь всё упиралось в процессор и оптимизацию.
Да, я ещё считал не pc-gamess'ом, а оригинальным gamess-us

Дело не в этом. Думаю, что смеяться не будут, а с интересом ознакомятся с Вашим расчетом.

Nord · Сообщение **Nord** » Вт сен 11, 2007 6:15 pm

Yurii писал(а):Дело не в этом. Думаю, что смеяться не будут, а с интересом ознакомятся с Вашим расчетом.

Знаете, мне как-то глубоко параллельно, будет ли кто-нибудь надо мной смеяться или нет.

Yurii · Сообщение **Yurii** » Вт сен 11, 2007 6:24 pm

Nord писал(а):
Yurii писал(а):Дело не в этом. Думаю, что смеяться не будут, а с интересом ознакомятся с Вашим расчетом.
Знаете, мне как-то глубоко параллельно, будет ли кто-нибудь надо мной смеяться или нет.

Точней - перпендикулярно. Понятно.

Форум химиков

Сравнение скоростей gaussian'а на машинах с IA32 и EM64T

Сравнение скоростей gaussian'а на машинах с IA32 и EM64T

Кто сейчас на конференции