Новости химической науки > Химический способ обнаружения поврежденных ДНК

Исследователи из США разработали новый способ детектирования повреждений ДНК. Метод может стать первым шагом в разработке молекулярных проб для изучения влияния химической модификации на свойства ДНК, а также дать новую информацию о том, какие из мутаций ДНК приводят к раковым заболеваниям.

Чаще всего действие химических канцерогенов заключается в алкилировании азотистых оснований. Алкилирование приводит к увеличению липофильности двойной спирали. Стерически загруженные продукты алкилирования могут не поддаваться внутриядерной репарации, что, в свою очередь приводит к закреплению мутаций и, в том числе и рака. Для точного понимания механизма канцерогенеза необходимо установление корреляции между структурой продукта алкилирования и его распределением в ДНК и канцерогенной опасностью мутагена.

Джиачанг Гонг (Jiachang Gong) и Шана Штурла (Shana Sturla) из Университета Миннесоты синтезировали первый нуклеозид, который может комплементарно спариться со стерически объемным сайтом мутации ДНК – O⁶-бензилдеоксигуанозином, наиболее часто образующимся под влиянием природных канцерогенов и мутагенов.

Для предсказания структуры нуклеозида, способного образовать прочную водородно-связанную пару с мутированным фрагментом ДНК исследователи прибегли к помощи молекулярного моделирования. Синтезированный нуклеозид не только прочно связывается с сайтом мутации, как и предсказывали компьютерные расчеты, но и распознает неповрежденные участки ДНК, оставляя их нетронутыми.

Генри Скаукрофт (Henry Scowcroft) из Центра по Исследованию Рака (Великобритания) отметил, что исследования в области синтеза искусственных нуклеозидов, распознающих участки ДНК-мутации, снабжают исследователей канцерогенеза новыми инструментами для анализа. Он отмечает, что изучение особенностей взаимодействия ДНК с природными мутагенами очень важно для понимания природы сохранения и умножения генетической информации.

Источник: J. Am. Chem. Soc. 2007, web advanced publish

метки статьи: #биохимия, #медицинская химия, #молекулярная биология